Zumindest im Anime verstehen Pokémon universell die menschliche Sprache und daraus wird auch kein Hehl gemacht, wenn die vielen Kämpfe betrachtet werden. Mit einfach zu merkenden Befehlen haben die Taktiken eher wenig zu tun und ich gehe auch davon aus, dass die Verantwortlichen hinter dem Anime nie die Intention hatten, da allzu groß zwischen dem Verständnis zu unterscheiden. Außer wenn sie denn Telepathie beherrschen und Legendäre oder Mysteriöse Pokémon in den Filmen tatsächlich sprechen können. Das ist allerdings wieder eine ganz andere Geschichte.
Persönlich denke ich, dass Pokémon eine Zeit lang benötigen, um sich überhaupt an die menschliche Sprache zu gewöhnen. Die erste gemeinsame Zeit könnte hier etwa mit Training sowie der allgemeinen Annäherung gleichgesetzt werden, um sich besser verstehen zu können. Sobald eine gewisse Hürde überwunden ist, sollte das gegenseitige Verständnis automatisch besser werden.