Ich verstehe dein Problem damit ehrlkich gesagt nicht .... Du hast doch grade eben selbst beschrieben was aus der Kristalledition stammt und wie es mit Elementen von G/S modifiziert wurde um daraus 2 Editionen zu machen das ist doch genu das was Thrue meinte.
Und wenn man die Rolle von Rayquaza aus Smaragt übernimmt und leicht Modifiziert hat man im grunde schon ein Gemisch aus der Smaragd und R/S Story ... R/S unterscheiden sich dann teilweise dich ein ganzes stück von Smaragd.
Es wurde von der Hauptstory nichts übernommen! Es gab einige erweiterungen (treffen von Lyra usw.) aber nichts von Kristall. Das mit Suicune ist nurnoch ein Sidequest. Die Hauptstory deckt sich hier mit GS.
Bei ORAS kommen Kyogre und Groudon jeweils aus der Unterwasserhöhle, damit hat man schon gezeigt, dass es keinen Kampf zwischen Kyogre und Groudon geben wird und somit wäre auch der Rayquazapart vollkommen überflüssig. Man wird wohl nach der Unterwasserhöhle in die Urzeithöhle geschikt wo man auf Groudon/Kyogre trifft und das wars, anderst lässt sich die Szene aus meinen Augen nicht deuten... Außerdem würde Rayquaza mit einem Auftritt wie in Smaragd Groudon/Kyogre die Show stehlen