troy sagt sogar, dass es nur einmal pro kampf geht
Afaik bezieht sich das aber tatsächlich auf eine Megaentwicklung pro Trainer und Kampf.
Erklären ließe sich das durch die Verwendung der Mega-Accessoires (also das Mega-Armband, das der Protagonist trägt und Troy's Mega-Accessoire, wo auch immer er das trägt): Die Wechselwirkung zwischen diesem Item und dem Megastein, der von dem jeweiligen Pokémon getragen wird, kann lediglich ein Mal pro Kampf stattfinden, danach ist die Energie erst einmal verbraucht.
Die Mega-Accessoires beeinflussen sich ja eigentlich nicht gegenseitig, denn aus X und Y wissen wir, dass auch der Gegner Mega-Entwicklungen einsetzten kann, wenn man selber schon eine Mega-Entwicklung ausgeführt hat, dementsprechend wird wohl diese Einschränkung nur auf einen Trainer gleichzeitig beziehen.